مؤلفاته ألف الإمام الذهبي كتبا كثيرة في عدة فنون كالقراءات ، والحديث وعلومه ، والعقائد ، والفقه وأصوله ، والسير ، والتاريخ مع تلخيصه لكتب كثيرة وتهذيبها وقد ذكر الدكتور بشار عواد ( ٢١٤ ) كتاباً له في دراسته (۹) ففى القراءات : التلويحات في علم القراءات وفي الحديث وعلومه : الأربعون البلدانية ، والثلاثون البلدانية ، وطرق حديث « من كنت مولاه فعلی مولاه » ، والكلام على حديث الطير ، وتلخيص المستدرك للحاكم ، ومختصر سنن البيهقى وكتاب الزيادة المضطربة ، وطرق أحاديث النزول ، والعذب المسلسل في الحديث المسلسل ، ومنية الطالب لأعز المطالب ، والموقظة في علم الحديث ، وذكر من يعتمد قوله في الجرح والتعديل · وفى علوم التاريخ والسير والطبقات والتراجم : تاريخ الإسلام ، وسير أعلام النبلاء ، والعبر ، وتذكرة الحفاظ ، والكاشف ، وطبقات القراء وميزان الاعتدال ، والمغنى فى الضعفاء وديوان الضعفاء وفى أصول الفقه : كتاب مسألة خبر الواحد و فى الفقه : تحريم أدبار النساء ، وتشبيه الخسيس بأهل الخميس ) مخطوط ) ، وجزء في الخضاب ( مفقود ) ، وجزء في صلاة التسبيح ) مفقود ) ، وجزء فى القهقهة ، وحقوق الجار والتمسك بالسنن وفي العقائد : أحاديث الصفات ، والأربعين في صفات رب العالمين ، و جزء في الشفاعة ، وجزءان فى صفة النار ، وكتاب رؤية البارى ، وكتاب العرش ، وكتاب العلو للعلى الغفار ، وكتاب الكبائر ، والروع والأوجال فى نبأ المسيح الدجال ، وكتاب ما بعد الموت ، وكتاب مسألة دوام النار وكتاب مسألة الغيبة ، وكتاب مسألة الوعيد (۹) الذهبي ومنهجه في تاريخ الإسلام ) ١٤٠ ب. ، ، 11