وهناك طريقتان للتهميش: الأولى: أن توضع لكل صفحة هوامشها الخاصة بها أسفلها، وهي الأكثر شيوعًا. والأخرى: أن تؤخر الهوامش وتوضع في ملحق آخر الكتاب. ويذهب آخرون إلى طريقة وسط وهي: وضع هوامش المقابلات أسفل الصفحات، أما هوامش التعليق والتخريج فتوضع في ملحق آخر الكتاب. طرق التهميش: ١- بالنسبة للآيات القرآنية: يذكر رقم السورة ثم رقم الآية هكذا: ٩/ ١٥٧ أو اسم السورة ورقم الآية مثل: سورة النساء آية: ٩٢، أو رمز السورة ورقمها، ورمز الآية ثم رقمها: س: ٣ آ: ٣٥. وقد يبدأ بالآية ثم السورة مثل: آية ٤٦ سورة الأعراف. تهميش تخريج النقول غير الآيات القرآنية: إذا كان الغرض من التهميش ذكر مصدر لم يذكر من قبل يتم على الوضع التالي: اسم الكتاب، فاصلة، اسم المؤلف ولقبه، اسم المحقق أو المترجم, فاصلة، مكان الطبع: نقطتان، الناشر، وتاريخ النشر ومكانه بين قوسين، رقم الطبعة، نوع الطبعة, بين خطين صغيرين, رقم الجزء فرقم الصفحة، مثال ذلك: الكشف عن القراءات السبع وعللها لمكي بن أبي طالب تحقيق محيي الدين رمضان بيروت، مؤسسة الرسالة سنة ١٩٨١م، ط ٢٠ جـ٢ ص٢٢٥. وإذا كان للكتاب أكثر من مؤلف أو من محقق يذكر الأول ثم يقال: وزميله أو زملاؤه. وفي حالة تكرار ذكر المرجع يكفي اسم المرجع والجزء والصفحة، مثل: وفيات الأعيان جـ٣ ص٩٥.